Metrics
Publication
77
Open Access
8
UN Sustainable Development Goals
Education
2004 - 2010
2004 - 2010Doctorate
Akdeniz University, Institute of Science, Biyoloji, Turkey
2001 - 2004
2001 - 2004Postgraduate
Akdeniz University, Institute of Science, Biyoloji, Turkey
1996 - 2001
1996 - 2001Undergraduate
Akdeniz University, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Turkey
Dissertations
2010
2010Doctorate
4T1 ve 4THMpc Fare Meme Kanseri hücre Hatlarında Talidomid'in Tek Başına ve Radyoterapi ile Kombine Olarak Anjiogenik Faktörlerden Substance P ve Substance P'yi Parçalayan ADAM 10 ve Neprilizin Enzimleri Üzerine Etkilerinin Araştırılması 
Akdeniz University, Biyoloji Bölümü, Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı
2001
2001Postgraduate
Demir Depo Proteini Ferritin'in Kemoterapötikleri Hapsetme Özelliğinin Araştırılması ve Geliştirilmesi
Akdeniz University, Biyoloji, Moleküler Biyoloji
Foreign Languages
B2 Upper Intermediate
B2 Upper IntermediateEnglish
Certificates, Courses and Trainings
2016
2016Computer-aided Drug Design
Education Management and Planning
Bahçeşehir Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyofizik Bölmü
2016
2016SteponePlus Real-Time PCR System
Education Management and Planning
MedSanTek Laboratuar Malzemleri LTD.
2013
2013FP7 Project Proposal Preparation and Submission & Project Management 2-day training programme
Education Management and Planning
Tübitak
2004
2004Biyoinformatik
Education Management and Planning
Ege ünversitesi
Research Areas
Life Sciences
Molecular Biology and Genetics
Moleculer Biology of Cancer
Protein Engineering
Neurobiology
Natural Sciences
Research Areas Based on Academic Activities
Avesis Research Areas
WoS Research Areas
Scopus Research Areas
Academic Positions
2018 - Present
2018 - PresentAssociate Professor
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences, Department of Nutrition and Dietetics
2018 - 2018
2018 - 2018Assistant Professor
Akdeniz University, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme ve Diyetetik Bölümü
2012 - 2018
2012 - 2018Assistant Professor
Akdeniz University, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme ve Diyetetik Bölümü
2001 - 2010
2001 - 2010Research Assistant
Akdeniz University, Institute of Science, Institute of Science
Managerial Experience
2022 - Present
2022 - PresentDeputy Head of Department
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences, Department of Nutrition and Dietetics
2022 - Present
2022 - PresentMember of Unit Quality Commission
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences, Department of Nutrition and Dietetics
2021 - Present
2021 - PresentHead of Department
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences, Department of Nutrition and Dietetics
2022 - 2024
2022 - 2024Erasmus Program Institutional Coordinator
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences, Department of Nutrition and Dietetics
2020 - 2022
2020 - 2022Member of the Faculty Board
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences
2019 - 2022
2019 - 2022Deputy Director of the Center
Akdeniz University, VEREM ÇALIŞMALARI UYGULAMA VE ARAŞTIRMA MERKEZİ
2018 - 2021
2018 - 2021Vice Dean
Akdeniz University, Faculty of Health Sciences
2015 - 2018
2015 - 2018Board Member
Akdeniz University, Antalya Sağlık Yüksekokulu
2015 - 2017
2015 - 2017Head of Department
Akdeniz University, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme ve Diyetetik Bölümü
Courses
Doctorate
Doctorate
Danışmanlık
3 D Moleküler Modelleme
Hücre Sinyal Yolakları
Nöropeptidler ve Kanser
Supervised Theses
in Progress
in ProgressDoctorate
FENİRAMİN HİDROJEN MALEAT’IN ANTİKANSER ETKİLERİNİN İLAÇ YENİDEN KONUMLANDIRMA KAPSAMINDA AKCİĞER KANSERİ MODELİ ÜZERİNDEN İN VİTRO VE İN SİLİKO DEĞERLENDİRİLMESİ
Şimşek E. (Advisor)
E.TANYEL(Student)
2024
2024Doctorate
SCARA5 reseptörünün SRCR bölgesinin hesaplamalı yapısal modellenmesi ve bilgisayar temelli ilaç tasarım yöntemi kullanılarak geliştirilecek reseptör bloker'ının MCF-7 insan meme kanser hücre hattındaki sitotoksik etkilerinin in vitro araştırılması
Şimşek E. (Advisor)
O.KOÇAK(Student)
2022
2022Postgraduate
Didymin Flavonoidinin İnsan Glioblastoma Hücre Hattı Üzerindeki Sitotoksik Etkisinin ve Bu Hücrelerden Salınan Substance P Ve İnterlökin-6 Miktarları Üzerine Etkilerinin İn Vitro Araştırılması
Şimşek E. (Advisor)
N.BULUT(Student)
2017
2017Postgraduate
Novalgin (metamizol Sodyum)'in İnsan Glioblastoma Hücre hattı U-87 MG Üzerine Potansiyel Anjiyogenik etkisinin in vitro araştırılması
ŞİMŞEK E.
O.KOÇAK(Student)
Articles
All (31)
SCI-E, SSCI, AHCI (24)
SCI-E, SSCI, AHCI, ESCI (29)
ESCI (5)
Scopus (25)
TRDizin (2)
Other Publications (1)
2025
20251. Combined effects of escitalopram and vitamin E on phoenixin-20 secretion and neuroregulatory mechanisms in glioblastoma cells: a neuro-nutritional perspective.
Aydemir İ., Tutkun G., Akcit E., Kocak O., Altinkaynak A., YILDIRIM K., et al.
Journal of neuro-oncology
, vol.175, no.2, pp.789-799, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20252. Being a woman researcher in dangerous laboratories: biosafety level 3 and tuberculosis.
YILDIRIM K., Koçak O., Baran M., Ataş C., Akçit E., Licina M., et al.
Philosophy, ethics, and humanities in medicine : PEHM
, vol.20, no.1, pp.36, 2025 (SCI-Expanded, AHCI, SSCI, Scopus)
2025
20253. Evaluation of Pheniramine Hydrogen Maleate in the Context of Drug Repositioning: Could an Innocent Histaminic be a Novel Hope?
Tanyel Akçit E., Şimşek E.
Journal of Balkan Science and Technology
, vol.4, no.1, pp.23-32, 2025 (Peer-Reviewed Journal)
2025
20254. Synthesis and biological evaluation of novel thioureas containing pyridine derivatives against Mycobacterium tuberculosis
YILDIRIM K., Karaçolak A. I., Kutlu E., Emen F. M., Ali M. A., ŞİMŞEK E., et al.
Journal of Sulfur Chemistry
, vol.46, no.6, pp.1142-1160, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20255. Novel aroylthioureas against Mycobacterium tuberculosis
Kutlu E., Emen F. M., Ali M. A., Karacolak A. I., Yesilkaynak T., YILDIRIM K., et al.
Phosphorus, Sulfur and Silicon and the Related Elements
, vol.200, no.6, pp.528-537, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2025
20256. The In Vitro and In Silico Assessment of the Cytotoxic Effect of Daidzein Alone or in Combination with 5-Fluorouracil on Human Colorectal Adenocarcinoma Cell Line Caco-2
Altinkaynak A., Kocak O., TANYEL AKÇİT E., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., ÇOBAN A. Y.
Journal of Medicinal Food
, 2025 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20247. The In vitro evaluation of in silico-designed synthetic peptides AKVUAM-1 and AKVUAM-2 on human lung fibroblast cell line MRC5 and Mycobacterium tuberculosis isolates
ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., Akcit E. T., Atas C., Kocak O., Altinkaynak A., et al.
Microbial Pathogenesis
, vol.197, 2024 (SCI-Expanded)
2024
20248. A rapid and simple modified nitrate reductase assay for testing first and second-line antituberculosis drug susceptibilities in Mycobacterium tuberculosis isolates
ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., Atas C., ÇOBAN A. Y.
Diagnostic Microbiology and Infectious Disease
, vol.110, no.4, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20249. The in vitro and in silico assessment of the proliferative and angiogenic potential of Substance K: Interaction of Substance K between the Neurokinin-1, Neurokinin-2, and Tie-2 receptor proteins
ŞİMŞEK E., TANYEL AKÇİT E., YILDIRIM K., KOÇAK O., BOZKURT S., ÇOBAN A. Y.
Chemical Biology Letters , vol.11, no.4, 2024 (ESCI)
2024
202410. Resazurin microplate test method for rapid determination of colistin resistance in carbapenem-resistant Acinetobacter baumanii isolates
Yildirim K., Simsek E., Kocak O., Bozkurt S., Koyuncu Ozyurt Ö., Coban A. Y.
Lab Medicine
, vol.55, no.3, pp.380-385, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
202411. Nitrate Reductase Assay for Rapid Determination of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Clinical Isolates
Yildirim K., Atas C., Tanyel Akcit E., Licina M., Koyuncu Ozyurt Ö., Gun M. A., et al.
Lab Medicine
, vol.55, no.2, pp.174-178, 2024 (SCI-Expanded)
2023
202312. Didymin Exhibits Different Cytotoxicity Patterns on U-87 MG Human Glioblastoma Cells and Orchestrates the Release of Substance P (SP) and Interleukin-6 (IL-6) in a Time Depending Manner
Bulut N., Şimşek E.
EURASIAN JOURNAL OF MEDICINE AND ONCOLOGY , vol.7, no.4, pp.326-333, 2023 (ESCI, TRDizin)
2023
202313. The Effect of Inoculum Size on Antimicrobial Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis
YILDIRIM K., Atas C., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
Microbiology spectrum
, vol.11, no.3, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202314. The Anti-angiogenic and Anti-microbial Effect of Diosmin: Potential Receptor Interactions via Molecular Docking
ŞİMŞEK E., Koçak O., YILDIRIM K., Kuruoğlu A., Taşkın N. D., Bozkurt S., et al.
Revista Brasileira de Farmacognosia
, vol.33, no.2, pp.422-431, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2023
202315. Novel thiourea derivatives against Mycobacterium tuberculosis: synthesis, characterization and molecular docking studies
Kutlu E., Emen F. M., Yıldırım K., Ataş C., Demirdogen R. E., Yesilkaynak T., et al.
Phosphorus, Sulfur and Silicon and the Related Elements
, vol.198, no.10, pp.844-853, 2023 (SCI-Expanded, Scopus)
2022
202216. A PARADOX FROM A NEUROTRANSMITTER: THE OPPOSITE EFFECTS OF SUBSTANCE P AND ITS PHYSIOLOGICAL FRAGMENTS SP (1-7) AND SP (9-11) ON THE PROLIFERATION OF HUMAN BREAST CANCER CELLS AND THE MIGRATION CAPABILITIES OF HUVEC CELLS
Koçak O., ŞİMŞEK E.
World Cancer Research Journal
, vol.9, 2022 (ESCI)
2021
202117. PROLIFERATIVE EFFECTS OF METAMIZOLE SODIUM ON U-87 MG GLIOBLASTOMA CELL LINE: A PAIN KILLER OR A KILLER?
KOÇAK O., ŞİMŞEK E.
WORLD CANCER RESEARCH JOURNAL
, vol.8, 2021 (ESCI, Scopus)
2020
202018. OVER KANSERİ HÜCRELERİNDE PRİMA-1 Met TEDAVİSİNE YANIT OLARAK DEĞİŞEN miRNA EKSPRESYON ANALİZİ
İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E.
SAĞLIK BİLİMLERİ DERGİSİ
, vol.29, pp.19-25, 2020 (TRDizin)
2019
201919. The Antiangiogenic Effects of Tamoxifen might be Attributed to Receptor Binding Capacity of its Solvent Dimethylsulfoxide in Breast Cancer: A Molecular Docking Study
Koçak O., Taskin N. D., ŞİMŞEK E.
JOURNAL OF PHARMACEUTICAL RESEARCH INTERNATIONAL
, vol.30, no.2, 2019 (ESCI)
2018
201820. Mechanism of the anti-angiogenic effect of Avemar on tumor cells
İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E.
ONCOLOGY LETTERS
, vol.15, no.2, pp.2673-2678, 2018 (SCI-Expanded, Scopus)
2017
201721. Caspase-mediated Apoptotic Effects of Ebenus boissieri Barbey Extracts on Human Cervical Cancer Cell Line HeLa
ŞİMŞEK E., İMİR N., Aydemir E., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.
PHARMACOGNOSY MAGAZINE
, vol.13, no.50, pp.254-259, 2017 (SCI-Expanded)
2016
201622. Endostatin and irradiation modifies ADAM 10 and Neprilysin activities in breast cancer cells
AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., KORCUM ŞAHİN A. F., FIŞKIN K.
MOLECULAR MEDICINE REPORTS
, vol.14, pp.2343-2351, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
2016
201623. Cytotoxic and immunomodulatory effects of Ebenus boissieri Barbey on breast cancer cells
İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.
GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH
, vol.15, no.1, 2016 (SCI-Expanded, Scopus)
2015
201524. Dimethyl sulfoxide-caused changes in pro- and anti-angiogenic factor levels could contribute to an anti-angiogenic response in HeLa cells
ŞİMŞEK E., Aydemir E. A., İMİR N., Koçak O., Kuruoğlu A., FIŞKIN K.
NEUROPEPTIDES
, vol.53, pp.37-43, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2015
201525. Cytotoxic and apoptotic effects of Ebenus boissieri Barbey on human lung cancer cell line A549
Aydemir E., ŞİMŞEK E., İMİR N., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.
PHARMACOGNOSY MAGAZINE
, vol.11, no.42, 2015 (SCI-Expanded)
2015
201526. Thalidomide combined with irradiation alters the activity of two proteases
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Korcum A. F., FIŞKIN K.
MOLECULAR MEDICINE REPORTS
, vol.11, no.2, pp.1535-1541, 2015 (SCI-Expanded, Scopus)
2012
201227. DMSO exhibits similar cytotoxicity effects to thalidomide in mouse breast cancer cells
Oz E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.
ONCOLOGY LETTERS
, vol.3, no.4, pp.927-929, 2012 (SCI-Expanded, Scopus)
2011
201128. Endostatin enhances radioresponse in breast cancer cells via alteration of substance P levels
Aydemir E., Oz E., Korcum A. F., FIŞKIN K.
ONCOLOGY LETTERS
, vol.2, no.5, pp.879-886, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)
2011
201129. Glycyrrhiza flavescens subsp antalyensis exerts antiproliferative effects on melanoma cells via altering Tnf and Ifn levels
ESRA ASLAN A., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., ÖZKAN G., FIŞKIN K.
Food And Chemical Toxicology
, vol.49, pp.820-828, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)
2011
201130. Thalidomide and irradiation combination therapy increases substance P levels in vitro
Oz E., AYDEMİR E., Korcum A. F., FIŞKIN K.
EXPERIMENTAL AND THERAPEUTIC MEDICINE
, vol.2, no.3, pp.529-535, 2011 (SCI-Expanded, Scopus)
2005
200531. Magic ferritin: A novel chemotherapeutic encapsulation bullet
Simsek E., Kilic M. A.
JOURNAL OF MAGNETISM AND MAGNETIC MATERIALS
, vol.293, no.1, pp.509-513, 2005 (SCI-Expanded, Scopus)
Papers Presented at Peer-Reviewed Scientific Conferences
2023
20231. IN VITRO CULTURE MODELS IN LATENT TUBERCULOSIS INFECTION
ATAŞ C., LİCİNA M., YILDIRIM K., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
4TH INTERNATIONAL LATIN AMERICAN CONGRESS ON NATURAL AND APPLIED SCIENCES, Rio de Janeiro, Brazil, 13 March 2023, pp.189-196, (Full Text)
2023
20232. INVESTIGATION OF THE BLOOD MICROBIOME PROFILE
GÖRGÜÇ S., ATAŞ C., YILDIRIM K., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
4TH INTERNATIONAL LATIN AMERICAN CONGRESS ON NATURAL AND APPLIED SCIENCES, Brazil, 13 March 2023, pp.176-188, (Full Text)
2023
20233. The Importance of Bedaquiline in the Treatment of Multidrug-Resistant Tuberculosis
LİCİNA M., ATAŞ C., YILDIRIM K., TANYEL AKÇİT E., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
INTERNATIONAL EUROPA SCIENTIFIC RESEARCHes CONGRESS, Ankara, Turkey, 26 February 2023, pp.121-123, (Full Text)
2023
20234. Probiyotikler ve SİBO
PEKŞEN İ. S., UÇAROĞLU A. K., UZUNER F., YILDIRIM K., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
INTERNATIONAL EUROPA SCIENTIFIC RESEARCHes CONGRESS, Ankara, Turkey, 26 February 2023, pp.124-128, (Full Text)
2023
20235. AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (FMF) DİNMEYEN BİR SANCI MI ?
BARAN M., KOÇAK O., TANYEL AKÇİT E., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., ÇOBAN A. Y.
1st International Conference on Trends in Advanced Research ICTAR 2023, Konya, Turkey, 4 - 07 March 2023, vol.1, pp.473, (Summary Text)
2023
20236. The Importance of Bedaquiline in the treatment of multidrug resistant tuberculosis
Licina M., Ataş C., YILDIRIM K., Tanyel Akçit E., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
International Europa Scientific Researches Congress, Turkey, 26 February 2023, (Full Text)
2023
20237. Probiyotikler ve SİBO
Pekşen İ. S., Uçaroğlu A. K., Uzuner F., YILDIRIM K., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
International Europa Scientific Research Congress, Turkey, 26 February 2023, (Full Text)
2022
20228. İnokulum Miktarı {Mycobacterium tuberculosis} Suşlarının İlaç Duyarlılık Sonuçlarını Gerçekten Etkiliyor mu? Yoksa Bu Sadece Bir Varsayım mı?
YILDIRIM K., ATAŞ C., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.
XL. ULUSLARARASI TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ, 16 November 2022, (Summary Text)
2021
20219. Çok Ilaca Dirençli (ÇİD) ve Yaygın Ilaç Direnci (YİD) olan Mycobacterium tuberculosis İzolatlarının Erken Tespitinde AYC-SENSITIVE’in Değerlendirilmesi
Yıldırım K., Şimşek E., Çoban A. Y.
9. BUHASDER Kongresi, Antalya, Turkey, 24 - 28 November 2021, pp.77, (Summary Text)
0
010. Cytotoxic effects of Glycyrrhiza flavescens subsp. Antalyensis on b16f10 mouse melanoma cells.
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., GÖKTÜRK R. S., FIŞKIN K.
Pharmacognosy Magazine, Abstracts book of 6th CMAPSEEC, Antalya, Turkey, pp.30, (Full Text)
2020
202011. A New Colorimetric Rapid Antibiotic Susceptibility Test Method for Determining Colistin Resistance in Acinetobacter baumanii Isolates
Yıldırım K., Şimşek E., Çoban A. Y., Koyuncu Özyurt Ö., Bozkurt S., Koçak O.
TMC 2020 Çevrim İçi Mikrobiyoloji Sempozyumu ONLİNE, İstanbul, Turkey, 25 - 27 December 2020, pp.22, (Full Text)
2017
201712. Metamizole could act as an angiogenic factor depending on the interaction of VEGFR2: a molecular docking study
Koçak O., ŞİMŞEK E.
VI. International Congress of Molecular Medicine Molecular Medicine from the, İstanbul, Turkey, 22 - 25 May 2017, pp.123, (Full Text)
2016
201613. homology modelling of scara5 protein
ŞİMŞEK E., Koçak O., Korkmaz S., Ekşi E.
4th BAU drug design congress, İstanbul, Turkey, 13 - 15 October 2016, pp.151, (Full Text)
2016
201614. The transcriptional regulation of gossypol-induced p21 expression via IRF-1 in human breast cancer cells
İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E.
9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaria, 26 - 29 May 2016, pp.125, (Summary Text)
2016
201615. CYTOTOXİC EFFECT OF CAPSAİCİN on HUMAN CERVİCAL CANCER CELL LİNE
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., İMİR N.
9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaria, 26 - 29 May 2016, pp.154, (Summary Text)
2016
201616. Apoptotic effects of diosmin
AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., İMİR N.
9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaria, 26 - 29 May 2016, pp.20, (Summary Text)
2015
201517. Substance P: A trivet between cancer, angiogenesis and pain
ŞİMŞEK E.
20th world congress on advances in oncology18th international symposium on molecular medicine, Atina, Greece, 8 - 10 October 2015, vol.36, no.1, pp.48, (Summary Text)
2014
201418. Meme Kanseri Hücreleri Üzerinde Ebenus boisserii Ekstraktlarının Sitotoksik ve İmmünomodülatör Etkileri
İMİR N., ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Kuruoğlu A., Yeşilada E., FIŞKIN K., et al.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Turkey, 23 - 27 June 2014, pp.1306, (Full Text)
2014
201419. Ebenus boissieri Barbey Ekstraktlarının A549 Hücrelerindeki Sitotoksik ve Apoptotik Etkileri
AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., İMİR N., Önel B., GÖKTÜRK R. S., Yeşilada E., et al.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Turkey, 23 - 27 June 2014, pp.1252, (Full Text)
2014
201420. Ebenus boissieri Ekstraktının HeLa Hücreleri üzerine Sitotoksik Etkileri
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., GÖKTÜRK R. S., İMİR N.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Turkey, 23 - 27 June 2014, pp.1, (Full Text)
2014
201421. Ebenus boissieri Ekstraktının HeLa Hücreleri Üzerine Sitotoksik Etkileri
ŞİMŞEK E., İMİR N., AYDEMİR E., Koçak O., GÖKTÜRK R. S., Yeşilada E., et al.
22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Turkey, 23 - 27 June 2014, pp.1278, (Full Text)
2011
201122. The effects of substance P fragments on breast cancer cells
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., KORCUM A. F., FIŞKIN K.
ASCO Breast Cancer Symposium., San Francisco, United States Of America, 8 - 10 September 2011, pp.295, (Summary Text)
2011
201123. Meme Kanseri Tedavisinde Substance P Fragmanlarının Rolü.
ŞİMŞEK E., KORCUM A. F., AYDEMİR E., FIŞKIN K.
XIX. Ulusal Kanser Kongresi, Antalya, Turkey, 20 - 24 April 2011, pp.337, (Full Text)
2010
201024. Old substance, an elderly drug, two executioners, and a new scenario
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., KORCUM A. F., ERİN N., FIŞKIN K.
ASCO Breast Cancer Symposium., Washington, United States Of America, 15 - 20 October 2010, pp.303, (Summary Text)
2010
201025. Combined treatment with radiotherapy and endostatin in breast cancer: Changes in substance P levels by activating ADAM-10, neprilysin.
AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., KORCUM A. F., ERİN N., FIŞKIN K.
ASCO Breast Cancer Symposium., Washington, United States Of America, 15 - 20 October 2010, pp.302, (Full Text)
2010
201026. DMSO is not innocent as we guess
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.
20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Turkey, 21 - 25 June 2010, pp.105, (Full Text)
2010
201027. In Vitro Cytotoxic Activity of Glycyrrhiza flavescens subsp. antalyensis.
Hatipoğlu C., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., FIŞKIN K.
20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Turkey, 21 - 25 June 2010, pp.1014, (Full Text)
2010
201028. Threat or treatment?
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.
20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Turkey, 21 - 25 June 2010, pp.106, (Full Text)
2010
201029. Cytotoxic effects of Glycyrrhiza flavescens subsp. Antalyensis on b16f10 mouse melanoma cells.
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., GÖKTÜRK R. S., FIŞKIN K.
Pharmacognosy Magazine, Abstracts book of 6th CMAPSEEC, Antalya, Turkey, 20 - 21 April 2010, vol.6, no.22, pp.64-65, (Full Text)
2007
200730. Testing the efficacy of substance P fragments as anti-tumor agents.
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K., KORCUM A. F., ERİN N., ŞANLIOĞLU S.
6th AFMC international Medicinal Chemistry Symposium,, İstanbul, Turkey, 8 - 11 July 2007, pp.45, (Full Text)
2006
200631. The antimicrobial effect of Glisin
ŞİMŞEK E., ODABAŞ KÖSE E., AYDEMİR E.
18. Ulusal biyoloji Kongresi, Aydın, Turkey, 26 - 30 June 2006, pp.145, (Full Text)
2005
200532. The Antitumoral and Biochemical Effects of Gossypol on Human Lung Cancer Cell Line H1299
ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.
ASCB 45th Annual meeting, San Fransisco, United States Of America, 10 - 14 December 2005, pp.44, (Summary Text)
2005
200533. The Antitumoral and Biochemical Effects of Gossypol on Human Cervix Cancer Cell Line ME-180
Aydemir E., Şimşek E., Fışkın K.
ASCB 45th Annual meeting, California, United States Of America, 10 - 14 December 2005, pp.60, (Summary Text)
2004
200434. A New Nano-Drug Encapsulation System (Oral Presentation)
ŞİMŞEK E., KILIÇ M. A.
International Biomed 2004 Meeting, Ankara, Turkey, 6 - 11 September 2004, pp.87, (Summary Text)
2004
200435. What is Inside it?
ŞİMŞEK E., KILIÇ M. A.
5th international Magnetic Microsphere Meeting, Lyon, France, 20 - 22 May 2004, pp.107, (Full Text)
Books
2025
20251. Mikrobiyota ve Obezite
SANDIKÇI Z., GÖZÜBÜYÜK E. C., YILDIRIM K., KAYNAKCI E., ŞİMŞEK E., İMİR N.
in: Beslenme ve Diyetetik Değerlendirmeleri, YILMAZ KOCAMAN ŞEMSİ GÜL, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.240-256, 2025
2025
20252. Bağırsaktaki Denge: Mikrobiyota Beslenme ve Kanser
ALTAŞI C., TUTKUN G., ALTINKAYNAK A., MEKİK Z. B., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., et al.
in: AKADEMİK PERSPEKTİFTEN BESLENME VE DİYETETİK, ŞİMŞEK ECE, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.1-23, 2025
2025
20253. Mikrobiyata ve Obezite
Sandıkçı Z., Gözübüyük E. C., YILDIRIM K., KAYNAKCI E., ŞİMŞEK E., İMİR N.
in: Beslenme ve Diyetetik Değerlendirmeleri, Kocaman Şemsi, Editor, Yaz Yayınları, pp.240-256, 2025
2025
20254. Postbiyotik ve Kanser
GÖZÜBÜYÜK E. C., ALTINKAYNAK A., TUTKUN G., MEKİK Z. B., YILDIRIM K., KAYNAKCI E., et al.
in: BESLENME VE DİYETETİK KONULARI, ŞİMŞEK ECE, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.20-34, 2025
2025
20255. KANSER İMMÜNOTERAPİSİNDE POTANSİYEL BİR BAĞIŞIKLIK KONTROL NOKTASI
MEKİK Z. B., ALTINKAYNAK A., TUTKUN G., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., KAYNAKCI E., et al.
in: AKADEMİK PERSPEKTİFTEN SAĞLIK BİLİMLERİ, BÜKECİK NECATİ, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.71-84, 2025
2024
20246. Kolon Kanseri Hastalarında Beslenme Yönetimi
ALTINKAYNAK A., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., ÇOBAN A. Y.
in: BESLENME VE DİYETETİKTE İLERİ ARAŞTIRMALAR, ŞİMŞEK ECE, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.83-102, 2024
2024
20247. Yapay Zeka Ve Sağlık: Biyomühendislik Perspektifinden Yenilikçi YaklaŞımlar
TUTKUN G., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., BİLGE U., ÖZDOĞAN M., ÇOBAN A. Y.
in: BİLGİSAYAR BİLİMLERİ VE MÜHENDİSLİĞİNDE İLERİ ARAŞTIRMALAR, KUTLUANA GÖKHAN, Editor, YAZ YAYINEVİ, pp.198-208, 2024
Funded Projects
2025 - 2027
2025 - 2027Acinetobacter baumannii İzolatlarında Kolistin Direncinin Hızlı Tespiti İçin Yenilikçi ve Kolorimetrik Test Kiti Geliştirilmesi
R&D Project of Group B
Yıldırım K. (Executive), Şimşek E., Kaynakcı E., Çoban A. Y.
2023 - 2025
2023 - 2025Feniramin Hidrojen Maleat'ın Antikanser Etkilerinin İlaç Yeniden Konumlandırma Kapsamında Akciğer Kanseri Modeli Üzerinden In vitro ve In siliko Değerlendirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP PhD
ŞİMŞEK E. (Executive), TANYEL AKÇİT E.
2023 - 2025
2023 - 2025
Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarında bedakulin direncinin belirlenmesi ve direnç ile ilişkili atpE pepQ ve Rv0678 gen mutasyonlarının araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
YILDIRIM K. (Executive), UZUN M., ATAŞ C., LİCİNA M., SALEHİ MOHERER M., ŞİMŞEK E., et al.
2022 - 2024
2022 - 2024
Mycobacterium tuberculosis İzolatlarında Primer AntiTüberküloz İlaç Duyarlılığı Üzerine İnokulum Konsantrasyonun Etkisinin Araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ÇOBAN A. Y. (Executive), MOHARER M. P. S., UZUN M., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., Ataş C.
2022 - 2024
2022 - 2024
In Siliko tasarlanan AKVUAM1 ve AKVUAM2 sentetik peptidlerinin İnsan Akciğer Fibroblast hücre hattı MRC5 ve Mycobacterium tuberculosis izolatlarına karşı etkinliklerinin in vitro araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ŞİMŞEK E. (Executive), YILDIRIM K., ÇOBAN A. Y., Kalay M., Yazıcı E., Şişaneci A., et al.
2022 - 2024
2022 - 2024Temozolomid (TMZ) dirençli ve normal Glioblastoma Multiforme (GBM) hücre hatlarında Donafenib ve Radyoterapi uygulamasının hücre sağkalımı açısından değerlendirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc
TANRIÖVER G. (Executive), KORCUM ŞAHİN A. F., ŞİMŞEK E., Yazıcı E.
2022 - 2024
2022 - 2024
Metastatik meme kanserinde Çinko (Zn) ve Melatoninin hücre çoğalmasına etkilerinin in vitro olarak değerlendirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc
TANRIÖVER G. (Executive), ŞİMŞEK E.
2021 - 2024
2021 - 2024
SCARA5 Reseptörünün SRCR Bölgesinin Hesaplamalı Yapısal Modellenmesi ve Bilgisayar Temelli İlaç Tasarım Yöntemi Kullanılarak Geliştirilecek Reseptör Bloker'ının MCF-7 İnsan Meme Kanser Hücre Hattındaki Sitotoksik Etkilerinin in Vitro Araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP PhD
ŞİMŞEK E. (Executive), KOÇAK O.
2021 - 2022
2021 - 2022Didymin Flavonoidinin İnsan Glioblastoma Hücre Hattı Üzerindeki Sitotoksik Etkisinin ve Bu Hücrelerden Salınan Substance P ve Interlökin-6 Miktarları Üzerine Etkilerinin İn Vitro Araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc
ŞİMŞEK E. (Executive), BULUT N.
2020 - 2022
2020 - 2022
Mycobacterium tuberculosis izolatlarında çok ilaca direnç ve yaygın ilaca direncin hızlı tespiti amacıyla ticari kit geliştirilmesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ÇOBAN A. Y. (Executive), ŞİMŞEK E., YILDIRIM K.
2020 - 2022
2020 - 2022Acinetobacter baumanii izolatlarında kolistin direncinin belirlenmesinde kolorimetrik yeni hızlı bir antibiyotik duyarlılık test yöntemi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
YILDIRIM K. (Executive), ÇOBAN A. Y., ŞİMŞEK E., Bozkurt S., Koçak O.
2020 - 2022
2020 - 2022
Substance K'nın MCF7 İnsan Meme Kanseri Hücrelerinden salınan Substance P, VEGF ve Thrombospondin-1 miktarları üzerine etkilerinin in vitro araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ŞİMŞEK E. (Executive), ÇOBAN A. Y., YILDIRIM K., KOÇAK O., BOZKURT S.
2018 - 2021
2018 - 2021
MCF7 İnsan Meme Kanseri Hücre Hattında Serotonin Reseptör Antagonisti Palonosetronun pro ve antianjiyogenik faktörler üzerine etkilerinin in vitro araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Infrastructure
ÇOBAN A. Y. (Executive), ŞİMŞEK E., KOCAOĞLU CENKCİ S., ÖZEN KÜÇÜKÇETİN İ., ÇOMAK GÖÇER E. M., KAMARLI ALTUN H., et al.
2017 - 2019
2017 - 2019
Over kanser hücrelerinde PRIMA1Met tedavisine yanıt olarak miRNA ekspresyon analizi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
İMİR N. (Executive), ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Koçak O.
2017 - 2019
2017 - 2019
P Maddesi fizyolojik fragmanları (SP 1-7 ve SP 9-11)'in MDA MB-231 İnsan meme kanseri hücre hattı ve HUVEC insan damar endotel hücre hattı üzerine anti-anjiyogenik etkilerinin in vitro araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Research Project
ŞİMŞEK E. (Executive), AYDEMİR E., İMİR N., Koçak O.
2016 - 2017
2016 - 2017Novalgin (Metamizol Sodyum)’in İnsan Glioblastoma Hücre Hattı U-87 MG Üzerine Potansiyel Anjiyogenik Etkisinin in vitro Araştırılması
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP MSc
ŞİMŞEK E. (Executive), Koçak O.
2014 - 2016
2014 - 2016Fen Fakültesi Araştırma Laboratuvarı Projesi
Project Supported by Higher Education Institutions , BAP Infrastructure
SÜMBÜL H. (Executive), ARPAÇ E., BURUNKAYA E., AKARSU M., Kesmez Ö., Gençer A., et al.
2007 - 2009
2007 - 2009
4T1 ve 4THMpc fare meme kanseri hücre hatlarında anti-anjiyogenik ilaçlar olan Talidomit ve Endostatin'in tek başlarına ve radyoterapi ile kombine olarak anjiyogenik faktörlerden substance P ve substance P'yi parçalayan ADAM 10 ve Neprilizin enzim aktiviteleri üzerine etkilerinin araştırılması
TUBITAK Project
Activities in Scientific Journals
2017 - Present
2017 - PresentNC Nutrition
Committee Member
2016 - Present
2016 - PresentJournal of Clinical Oncology
Committee Member
Peer Reviews in Scientific Publications
March 2017
March 2017Jurnal of clinical Oncology
Other Indexed Journal
February 2017
February 2017Journal of Clinical Oncology
Other Indexed Journal
Scientific Project Refereeing
May 2015
May 2015TUBITAK Project
Awards
Congress and Symposium Activities
01 October 2016 - 01 October 2016
01 October 2016 - 01 October 20164th BAU Drug Design Congress
Attendee
İstanbul-Turkey
01 October 2015 - 01 October 2015
01 October 2015 - 01 October 2015the 20th world congress on advances in oncology and 18th international symposium on moleular medicine
Attendee
Atina-Greece
01 October 2015 - 01 October 2015
01 October 2015 - 01 October 2015The 20th world congress on advances in oncology and 18th international symposium on molecular medicine
Session Moderator
Athens-Greece
Scholarships
2006 - 2006
2006 - 2006EMBO-Short-term- Fellowship
Other International Organizations
Citations
Total Citations (WOS): 90
h-index (WOS): 5
Jury Memberships
January-2018
January 2018Assistant Professorship Appointment Committee
- Akdeniz Üniversitesi
December-2017
December 2017Assistant Professorship Appointment Committee
- Akdeniz Üniversitesi
January-2014
January 2014