Doç. Dr. ECE ŞİMŞEK

Metrikler

Yayın

Atıf (WoS)

H-İndeks (WoS)

Atıf (Scopus)

125

H-İndeks (Scopus)

Proje

Tez Danışmanlığı

Açık Erişim

BM Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Eğitim Bilgileri

2004 - 2010

Doktora

Akdeniz Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Türkiye

2001 - 2004

Yüksek Lisans

Akdeniz Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Türkiye

1996 - 2001

Lisans

Akdeniz Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji, Türkiye

Yaptığı Tezler

2010

Doktora

4T1 ve 4THMpc Fare Meme Kanseri hücre Hatlarında Talidomid'in Tek Başına ve Radyoterapi ile Kombine Olarak Anjiogenik Faktörlerden Substance P ve Substance P'yi Parçalayan ADAM 10 ve Neprilizin Enzimleri Üzerine Etkilerinin Araştırılması

Akdeniz Üniversitesi, Biyoloji Bölümü, Moleküler Biyoloji Anabilim Dalı

2001

Yüksek Lisans

Demir Depo Proteini Ferritin'in Kemoterapötikleri Hapsetme Özelliğinin Araştırılması ve Geliştirilmesi

Akdeniz Üniversitesi, Biyoloji, Moleküler Biyoloji

Yabancı Diller

B2 Orta Üstü

İngilizce

Sertifika, Kurs ve Eğitimler

2016

Computer-aided Drug Design

Eğitim Yönetimi ve Planlama

Bahçeşehir Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Biyofizik Bölmü

2016

SteponePlus Real-Time PCR System

Eğitim Yönetimi ve Planlama

MedSanTek Laboratuar Malzemleri LTD.

2013

FP7 Project Proposal Preparation and Submission & Project Management 2-day training programme

Eğitim Yönetimi ve Planlama

Tübitak

2004

Biyoinformatik

Eğitim Yönetimi ve Planlama

Ege ünversitesi

Araştırma Alanları

Yaşam Bilimleri

Moleküler Biyoloji ve Genetik

Kanser Moleküler Biyolojisi

Protein Mühendisliği

Nörobiyoloji

Temel Bilimler

Akademik Unvanlar / Görevler

2018 - Devam Ediyor

Doç. Dr.

Akdeniz Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Fakültesi, Beslenme Ve Diyetetik

2018 - 2018

Dr. Öğr. Üyesi

Akdeniz Üniversitesi, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme Ve Diyetetik

2012 - 2018

Yrd. Doç. Dr.

Akdeniz Üniversitesi, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme Ve Diyetetik

2001 - 2010

Araştırma Görevlisi

Akdeniz Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Biyoloji

Yönetimsel Görevler

2015 - 2018

Yönetim Kurulu Üyesi

Akdeniz Üniversitesi, Antalya Sağlık Yüksekokulu

2016 - 2017

Bölüm Başkanı

Akdeniz Üniversitesi, Antalya Sağlık Yüksekokulu, Beslenme Ve Diyetetik

Verdiği Dersler

Yüksek Lisans

Anjiyogenezin Temel İlkeleri

Lisans

Mikrobiyoloji ve Parazitoloji

Yönetilen Tezler

2017

Yüksek Lisans

Novalgin (metamizol Sodyum)'in İnsan Glioblastoma Hücre hattı U-87 MG Üzerine Potansiyel Anjiyogenik etkisinin in vitro araştırılması

ŞİMŞEK E.

O.KOÇAK(Öğrenci)

SCI, SSCI ve AHCI İndekslerine Giren Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2024

The In vitro evaluation of in silico-designed synthetic peptides AKVUAM-1 and AKVUAM-2 on human lung fibroblast cell line MRC5 and Mycobacterium tuberculosis isolates

ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., Akcit E. T., Atas C., Kocak O., Altinkaynak A., et al.

Microbial Pathogenesis , cilt.197, 2024 (SCI-Expanded)

2024

A rapid and simple modified nitrate reductase assay for testing first and second-line antituberculosis drug susceptibilities in Mycobacterium tuberculosis isolates

ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., Atas C., ÇOBAN A. Y.

Diagnostic Microbiology and Infectious Disease , cilt.110, sa.4, 2024 (SCI-Expanded)

2023

The Effect of Inoculum Size on Antimicrobial Susceptibility Testing of Mycobacterium tuberculosis

YILDIRIM K., Atas C., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.

Microbiology spectrum , cilt.11, sa.3, 2023 (SCI-Expanded)

2023

The Anti-angiogenic and Anti-microbial Effect of Diosmin: Potential Receptor Interactions via Molecular Docking

ŞİMŞEK E., Koçak O., YILDIRIM K., Kuruoğlu A., Taşkın N. D., Bozkurt S., et al.

Revista Brasileira de Farmacognosia , cilt.33, sa.2, ss.422-431, 2023 (SCI-Expanded)

2023

Novel thiourea derivatives against Mycobacterium tuberculosis: synthesis, characterization and molecular docking studies

Kutlu E., Emen F. M., Yıldırım K., Ataş C., Demirdogen R. E., Yesilkaynak T., et al.

Phosphorus, Sulfur and Silicon and the Related Elements , cilt.198, sa.10, ss.844-853, 2023 (SCI-Expanded)

2017

Caspase-mediated Apoptotic Effects of Ebenus boissieri Barbey Extracts on Human Cervical Cancer Cell Line HeLa

ŞİMŞEK E., İMİR N., Aydemir E., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.

PHARMACOGNOSY MAGAZINE , cilt.13, sa.50, ss.254-259, 2017 (SCI-Expanded)

2016

Endostatin and irradiation modifies ADAM 10 and Neprilysin activities in breast cancer cells

AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., KORCUM ŞAHİN A. F., FIŞKIN K.

MOLECULAR MEDICINE REPORTS , cilt.14, ss.2343-2351, 2016 (SCI-Expanded)

2016

Cytotoxic and immunomodulatory effects of Ebenus boissieri Barbey on breast cancer cells

İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.

GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH , cilt.15, sa.1, 2016 (SCI-Expanded)

2015

Dimethyl sulfoxide-caused changes in pro- and anti-angiogenic factor levels could contribute to an anti-angiogenic response in HeLa cells

ŞİMŞEK E., Aydemir E. A., İMİR N., Koçak O., Kuruoğlu A., FIŞKIN K.

NEUROPEPTIDES , cilt.53, ss.37-43, 2015 (SCI-Expanded)

2015

Cytotoxic and apoptotic effects of Ebenus boissieri Barbey on human lung cancer cell line A549

Aydemir E., ŞİMŞEK E., İMİR N., GÖKTÜRK R. S., Yesilada E., FIŞKIN K.

PHARMACOGNOSY MAGAZINE , cilt.11, sa.42, 2015 (SCI-Expanded)

2015

Thalidomide combined with irradiation alters the activity of two proteases

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Korcum A. F., FIŞKIN K.

MOLECULAR MEDICINE REPORTS , cilt.11, sa.2, ss.1535-1541, 2015 (SCI-Expanded)

2015

Substance P: A trivet between cancer, angiogenesis and pain

ŞİMŞEK E.

INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE , cilt.36, 2015 (SCI-Expanded)

2012

DMSO exhibits similar cytotoxicity effects to thalidomide in mouse breast cancer cells

Oz E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.

ONCOLOGY LETTERS , cilt.3, sa.4, ss.927-929, 2012 (SCI-Expanded)

2011

Glycyrrhiza flavescens subsp antalyensis exerts antiproliferative effects on melanoma cells via altering Tnf and Ifn levels

ESRA ASLAN A., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., ÖZKAN G., FIŞKIN K.

Food And Chemical Toxicology , cilt.49, ss.820-828, 2011 (SCI-Expanded)

2011

Thalidomide and irradiation combination therapy increases substance P levels in vitro

Oz E., AYDEMİR E., Korcum A. F., FIŞKIN K.

EXPERIMENTAL AND THERAPEUTIC MEDICINE , cilt.2, sa.3, ss.529-535, 2011 (SCI-Expanded)

2007

Testing the efficacy of substance P fragments as antitumor agents

Erin N., Korcum A. F., Simsek E., Aydemir E., Sanlioglu S.

DRUGS OF THE FUTURE , cilt.32, ss.58, 2007 (SCI-Expanded)

2005

Magic ferritin: A novel chemotherapeutic encapsulation bullet

Simsek E., Kilic M. A.

JOURNAL OF MAGNETISM AND MAGNETIC MATERIALS , cilt.293, sa.1, ss.509-513, 2005 (SCI-Expanded)

Diğer Dergilerde Yayınlanan Makaleler

2024

The in vitro and in silico assessment of the proliferative and angiogenic potential of Substance K: Interaction of Substance K between the Neurokinin-1, Neurokinin-2, and Tie-2 receptor proteins

ŞİMŞEK E., TANYEL AKÇİT E., YILDIRIM K., KOÇAK O., BOZKURT S., ÇOBAN A. Y.

Chemical Biology Letters , cilt.11, sa.4, 2024 (ESCI)

2023

Didymin Exhibits Different Cytotoxicity Patterns on U-87 MG Human Glioblastoma Cells and Orchestrates the Release of Substance P (SP) and Interleukin-6 (IL-6) in a Time Depending Manner

Bulut N., Şimşek E.

EURASIAN JOURNAL OF MEDICINE AND ONCOLOGY , cilt.7, sa.4, ss.326-333, 2023 (ESCI)

2022

A PARADOX FROM A NEUROTRANSMITTER: THE OPPOSITE EFFECTS OF SUBSTANCE P AND ITS PHYSIOLOGICAL FRAGMENTS SP (1-7) AND SP (9-11) ON THE PROLIFERATION OF HUMAN BREAST CANCER CELLS AND THE MIGRATION CAPABILITIES OF HUVEC CELLS

Koçak O., ŞİMŞEK E.

World Cancer Research Journal , cilt.9, 2022 (ESCI)

2020

OVER KANSERİ HÜCRELERİNDE PRİMA-1 Met TEDAVİSİNE YANIT OLARAK DEĞİŞEN miRNA EKSPRESYON ANALİZİ

İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E.

SAĞLIK BİLİMLERİ DERGİSİ , cilt.29, ss.19-25, 2020 (Hakemli Dergi)

2019

The Antiangiogenic Effects of Tamoxifen might be Attributed to Receptor Binding Capacity of its Solvent Dimethylsulfoxide in Breast Cancer: A Molecular Docking Study

Koçak O., Taskin N. D., ŞİMŞEK E.

JOURNAL OF PHARMACEUTICAL RESEARCH INTERNATIONAL , cilt.30, sa.2, 2019 (ESCI)

Hakemli Kongre / Sempozyum Bildiri Kitaplarında Yer Alan Yayınlar

2023

The Importance of Bedaquiline in the Treatment of Multidrug-Resistant Tuberculosis

LİCİNA M., ATAŞ C., YILDIRIM K., TANYEL AKÇİT E., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.

INTERNATIONAL EUROPA SCIENTIFIC RESEARCHes CONGRESS, Ankara, Türkiye, 26 Şubat 2023, ss.121-123

2023

AİLESEL AKDENİZ ATEŞİ (FMF) DİNMEYEN BİR SANCI MI ?

BARAN M., KOÇAK O., TANYEL AKÇİT E., ŞİMŞEK E., YILDIRIM K., ÇOBAN A. Y.

1st International Conference on Trends in Advanced Research ICTAR 2023, Konya, Türkiye, 4 - 07 Mart 2023, cilt.1, ss.473

2023

The Importance of Bedaquiline in the treatment of multidrug resistant tuberculosis

Licina M., Ataş C., YILDIRIM K., Tanyel Akçit E., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.

International Europa Scientific Researches Congress, Türkiye, 26 Şubat 2023

2023

Probiyotikler ve SİBO

Pekşen İ. S., Uçaroğlu A. K., Uzuner F., YILDIRIM K., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.

International Europa Scientific Research Congress, Türkiye, 26 Şubat 2023

2022

İnokulum Miktarı {Mycobacterium tuberculosis} Suşlarının İlaç Duyarlılık Sonuçlarını Gerçekten Etkiliyor mu? Yoksa Bu Sadece Bir Varsayım mı?

YILDIRIM K., ATAŞ C., ŞİMŞEK E., ÇOBAN A. Y.

XL. ULUSLARARASI TÜRK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ, 16 Kasım 2022

2020

Acinetobacter baumanii İzolatlarında Kolistin Direncinin Belirlenmesinde Kolorimetrik Yeni Hızlı Bir Antibiyotik Duyarlılık Test Yöntemi

Yıldırım K., Şimşek E., Çoban A. Y., Koyuncu Özyurt Ö., Bozkurt S., Koçak O.

TMC 2020 Çevrim İçi Mikrobiyoloji Sempozyumu ONLİNE, İstanbul, Türkiye, 25 - 27 Aralık 2020, ss.22

2017

Metamizole could act as an angiogenic factor depending on the interaction of VEGFR2: a molecular docking study

Koçak O., ŞİMŞEK E.

VI. International Congress of Molecular Medicine Molecular Medicine from the, İstanbul, Türkiye, 22 - 25 Mayıs 2017, ss.123

2016

homology modelling of scara5 protein

ŞİMŞEK E., Koçak O., Korkmaz S., Ekşi E.

4th BAU drug design congress, İstanbul, Türkiye, 13 - 15 Ekim 2016, ss.151

2016

The transcriptional regulation of gossypol-induced p21 expression via IRF-1 in human breast cancer cells

İMİR N., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E.

9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaristan, 26 - 29 Mayıs 2016, ss.125

2016

CYTOTOXİC EFFECT OF CAPSAİCİN on HUMAN CERVİCAL CANCER CELL LİNE

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., İMİR N.

9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaristan, 26 - 29 Mayıs 2016, ss.154

2016

Apoptotic effects of diosmin

AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., İMİR N.

9th CMAPSEEC, Plovdiv, Bulgaristan, 26 - 29 Mayıs 2016, ss.20

2015

Substance P: A trivet between cancer, angiogenesis and pain

ŞİMŞEK E.

20th world congress on advances in oncology18th international symposium on molecular medicine, Atina, Yunanistan, 8 - 10 Ekim 2015, cilt.36, sa.1, ss.48

2014

Meme Kanseri Hücreleri Üzerinde Ebenus boisserii Ekstraktlarının Sitotoksik ve İmmünomodülatör Etkileri

İMİR N., ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Kuruoğlu A., Yeşilada E., FIŞKIN K., et al.

22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1306

2014

Ebenus boissieri Barbey Ekstraktlarının A549 Hücrelerindeki Sitotoksik ve Apoptotik Etkileri

AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., İMİR N., Önel B., GÖKTÜRK R. S., Yeşilada E., et al.

22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1252

2014

Ebenus boissieri Ekstraktının HeLa Hücreleri Üzerine Sitotoksik Etkileri

ŞİMŞEK E., İMİR N., AYDEMİR E., Koçak O., GÖKTÜRK R. S., Yeşilada E., et al.

22. Ulusal Biyoloji Kongresi, Eskişehir, Türkiye, 23 - 27 Haziran 2014, ss.1278

2011

The effects of substance P fragments on breast cancer cells

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., KORCUM A. F., FIŞKIN K.

ASCO Breast Cancer Symposium., San Francisco, Amerika Birleşik Devletleri, 8 - 10 Eylül 2011, ss.295

2011

Meme Kanseri Tedavisinde Substance P Fragmanlarının Rolü.

ŞİMŞEK E., KORCUM A. F., AYDEMİR E., FIŞKIN K.

XIX. Ulusal Kanser Kongresi, Antalya, Türkiye, 20 - 24 Nisan 2011, ss.337

2010

Old substance, an elderly drug, two executioners, and a new scenario

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., KORCUM A. F., ERİN N., FIŞKIN K.

ASCO Breast Cancer Symposium., Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 15 - 20 Ekim 2010, ss.303

2010

Combined treatment with radiotherapy and endostatin in breast cancer: Changes in substance P levels by activating ADAM-10, neprilysin.

AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., KORCUM A. F., ERİN N., FIŞKIN K.

ASCO Breast Cancer Symposium., Washington, Amerika Birleşik Devletleri, 15 - 20 Ekim 2010, ss.302

2010

Threat or treatment?

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.

20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Türkiye, 21 - 25 Haziran 2010, ss.106

2010

In Vitro Cytotoxic Activity of Glycyrrhiza flavescens subsp. antalyensis.

Hatipoğlu C., AYDEMİR E., ŞİMŞEK E., GÖKTÜRK R. S., FIŞKIN K.

20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Türkiye, 21 - 25 Haziran 2010, ss.1014

2010

DMSO is not innocent as we guess

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.

20. Ulusal Biyoloji Kongresi, Denizli, Türkiye, 21 - 25 Haziran 2010, ss.105

2010

Cytotoxic effects of Glycyrrhiza flavescens subsp. Antalyensis on b16f10 mouse melanoma cells.

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., GÖKTÜRK R. S., FIŞKIN K.

Pharmacognosy Magazine, Abstracts book of 6th CMAPSEEC, Antalya, Türkiye, 20 - 21 Nisan 2010, cilt.6, sa.22, ss.64-65

2007

Testing the efficacy of substance P fragments as anti-tumor agents.

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K., KORCUM A. F., ERİN N., ŞANLIOĞLU S.

6th AFMC international Medicinal Chemistry Symposium,, İstanbul, Türkiye, 8 - 11 Temmuz 2007, ss.45

2006

The antimicrobial effect of Glisin

ŞİMŞEK E., ODABAŞ KÖSE E., AYDEMİR E.

18. Ulusal biyoloji Kongresi, Aydın, Türkiye, 26 - 30 Haziran 2006, ss.145

2005

The Antitumoral and Biochemical Effects of Gossypol on Human Lung Cancer Cell Line H1299

ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., FIŞKIN K.

ASCB 45th Annual meeting, San Fransisco, Amerika Birleşik Devletleri, 10 - 14 Aralık 2005, ss.44

2005

The Antitumoral and Biochemical Effects of Gossypol on Human Cervix Cancer Cell Line ME-180

Aydemir E., Şimşek E., Fışkın K.

ASCB 45th Annual meeting, California, Amerika Birleşik Devletleri, 10 - 14 Aralık 2005, ss.60

2004

A New Nano-Drug Encapsulation System (Oral Presentation)

ŞİMŞEK E., KILIÇ M. A.

International Biomed 2004 Meeting, Ankara, Türkiye, 6 - 11 Eylül 2004, ss.87

2004

What is Inside it?

ŞİMŞEK E., KILIÇ M. A.

5th international Magnetic Microsphere Meeting, Lyon, Fransa, 20 - 22 Mayıs 2004, ss.107

Desteklenen Projeler

2018 - 2021

MCF7 İnsan Meme Kanseri Hücre Hattında Serotonin Reseptör Antagonisti Palonosetronun pro ve antianjiyogenik faktörler üzerine etkilerinin in vitro araştırılması

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

ÇOBAN A. Y. (Yürütücü), ŞİMŞEK E., KOCAOĞLU CENKCİ S., ÖZEN KÜÇÜKÇETİN İ., ÇOMAK GÖÇER E. M., KAMARLI ALTUN H., et al.

2017 - 2019

Over kanser hücrelerinde PRIMA1Met tedavisine yanıt olarak miRNA ekspresyon analizi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

İMİR N. (Yürütücü), ŞİMŞEK E., AYDEMİR E., Koçak O.

2014 - 2016

Fen Fakültesi Araştırma Laboratuvarı Projesi

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje

SÜMBÜL H. (Yürütücü), ARPAÇ E., BURUNKAYA E., AKARSU M., Kesmez Ö., Gençer A., et al.

2007 - 2009

4T1 ve 4THMpc fare meme kanseri hücre hatlarında anti-anjiyogenik ilaçlar olan Talidomit ve Endostatin'in tek başlarına ve radyoterapi ile kombine olarak anjiyogenik faktörlerden substance P ve substance P'yi parçalayan ADAM 10 ve Neprilizin enzim aktiviteleri üzerine etkilerinin araştırılması

TÜBİTAK Projesi

Bilimsel Dergilerdeki Faaliyetler

2017 - Devam Ediyor

NC Nutrition

Editörler Kurulu Üyesi

2016 - Devam Ediyor

Journal of Clinical Oncology

Editörler Kurulu Üyesi

Bilimsel Hakemlikler

Mart 2017

Jurnal of clinical Oncology

Diğer İndekslerce Taranan Dergi

Şubat 2017

Journal of Clinical Oncology

Diğer İndekslerce Taranan Dergi

Mayıs 2015

TÜBİTAK Projesi

Ödüller

Mayıs 2004

Best Scientific Poster

Clevland Clinic Foundation

Kongre ve Sempozyum Katılımı Faaliyetleri

01 Ekim 2016 - 01 Ekim 2016

4th BAU Drug Design Congress

Katılımcı

İstanbul-Türkiye

01 Ekim 2015 - 01 Ekim 2015

the 20th world congress on advances in oncology and 18th international symposium on moleular medicine

Katılımcı

Atina-Yunanistan

01 Ekim 2015 - 01 Ekim 2015