DOMATESTE KÜLLEME HASTALIK ETMENİ Leveillula taurica’YA KARŞI CRISPR-CAS9 TABANLI GEN DÜZENLEME PROTOKOLÜNÜN GELİŞTİRİLMESİ
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Akdeniz Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bitki Koruma Bölümü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2026
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Gülsüm KOCAKAYA
Danışman: Özer Çalış
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:
Dünyada en
yaygın yetiştiriciliği yapılan sebzelerden birisi domates (Solanum
lycopersicum) olup Solanaceae familyasında yer almaktadır. Sevilerek
tüketilen domatesin ekim alanları her yıl genişlemeye devam etmektedir. Ancak ekonomik
olarak önemli bu sebzenin üretimini kısıtlayan fungal hastalıklar bulunmakta
olup bu fungal hastalıkların en başında külleme hastalığına sebep olan
Leveillula taurica gelmektedir. Obligat patojen fungusun kontrolü için en
iyi yöntem dayanıklı domates çeşitlerini geliştirmektir. Bu çalışmanın amacı külleme
hastalık etmeni L. taurica ya genetik olarak dayanıklı salkım domates geliştirmek
için biyoteknolojik yöntemlerden CRISPR-CAS9 tabanlı gen düzenleme yöntemini
kullanarak domateste hassaslıktan sorumlu SlMLO1 geni üzerinde mutasyon
meydana getirerek transgenik olmayan dayanıklı domates çeşidi geliştirilmesini
sağlamaktadır. Bunun için önce MLO1 geni ticari salkım
domates içerisinde spesifik primerlerle PCR da çoğaltılmış, elde edilen 1262 bp
büyüklüğündeki MLO1 geni incelenerek bu genin birinci ekzon bölgesine
yönelik bir rehber RNA, hedef RNA ve palindromik sekansları içeren CRISPR-CAS9
sisteminin ögeleri oluşturulmuştur. Tasarlanan mutasyon için önce gRNA, tRNAve
palindromik sekanslar klonlanarak önce Escherichia coli DH5α plazmidine
aktarıldı. Sonra CRISPR-CAS9 gene düzenlemesi pHEE401E ticari binari vektörü E. coli DH5α çoğaltılarak
klonlandı. Klonlanan binari vektördeki nükleik asit dizilimleri sanger sekanlama
yapılarak doğrulanmıştır. pHEE401E plazmidi uygun restriksiyon enzimleri ile
kesildikten sonra Agrobacterium tumefaciens EHA105 bakteri içerisine
elektroporasyon ile yerleştirilerek istediğimiz SlMLO1 geni üzerinde Slmlo1
gen mutasyonuna sebep olan CRISPR-CAS9 gen düzenleme sistemi oluşturulmuştur.
Gelecekte oluşturulan bu CISPR-CAS9 gen düzenleme sistemiyle ticari salkım
domates çeşitlerinde küllemeye dayanıklı çeşitlerin geliştirilmesi mümkün
olacaktır.