Denizli ve Gerze Tavuk Irklarında TLR3 TLR4 TLR5 ve TLR15 Reseptörlerinin in vivo ve in vitro Şartlarda Genetik Polimorfizminin Araştırılması


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Akdeniz Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü, Türkiye

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Leyla BENER

Danışman: Demir Özdemir

Özet:

Tavuklarda bağışıklık sistemini etkileyen mikroorganizmalar, bakteri, virüs, mantar ve parazit kaynaklı olabilmektedir. Kanatlı bağışıklık sistemi sonradan kazanılan ve doğuştan gelen bağışıklık sistemi olmak üzere ikiye ayrılmaktadır. Sonradan kazanılan bağışıklık sistemi, istilacı patojenlere karşı ilkel bir koruma sağlarken doğuştan gelen bağışıklık sistemi, mikrobiyal ajanların varlığını patojen tanıma reseptörleri (PRR) yardımıyla saptamaktadır. Bu reseptörlerden Toll-benzeri reseptörleri (TLR), tavuklarda immun yanıtı aktive edilmesinde, bağışıklık homeostazının sağlanmasında, enfeksiyonlara karşı savunmada ve hastalıklara karşı direnç mekanizmasında oldukça önemli role sahiptirler. Doğuştan gelen bağışıklık sisteminin tanıma reseptörleri olan TLR’ler ile ilgili bağışıklık sisteminin işlevi ve hastalığa karşı direnç hakkında temel bilgi sağladığından son yıllarda özellikle yerel tavuk ırklarının TLR potansiyelleri üzerine çalışmalar yoğunlaşmıştır. Bu kapsamda önerilen doktora tez çalışması Denizli ve Gerze yerli tavuk ırklarının bazı hastalıklarla ilişkilendirilen ChTLR3, ChTLR4, ChTLR5 ve ChTLR15 reseptörlerinin polimorfizminin ve hücre kültür ortamlarında bu reseptörlerin ekspresyon seviyelerinin genetik potansiyelinin araştırılması hedeflenmektedir. Çalışma Akdeniz Üniversitesi Ziraat Fakültesi Tarımsal Biyoteknoloji Bölümü laboratuvarlarında iki aşamada gerçekleştirilecektir. Tez projesinin ilk aşamasında her bir ırkı temsilen 6 bireyden alınacak kan örneklerinde ChTLR3, ChTLR4, ChTLR5 ve ChTLR15 reseptörlerinin polimorfizmi yeni nesil dizileme yöntemi ile incelenecektir. Çalışmanın ikinci aşamasında her bir ırkı temsilen 4 bireyden alınan kan örneklerinde hücre kültürü çalışılacaktır. İzole edilecek eritrosit hücreleri farklı oligodinükleotit ve Poli I:C konsantrasyonlarında (Yüksek, düşük ve kontrol grubu) hazırlanan medyuma alınacaktır. Farklı konsantrasyonların uygulanacağı hücre kültürü ortamlarında oligodinükleotit ve Poli I:C ‘ye bağlı ChTLR3, ChTLR4, ChTLR5 ve ChTLR15 gen reseptörlerinin ekspresyon seviyeleri qPCR yöntemi ile saptanacaktır. Önerilen doktora tez projesi ile Türkiye’nin farklı bölgelerine adapte olmuş Denizli ve Gerze yerli tavuk ırklarına ait ChTLR3, ChTLR4, ChTLR5 ve ChTLR15 reseptörlerinin ekspresyon seviyelerinin ve genetik polimorfizminin belirlenmesi mümkün olacaktır. Elde edilecek sonuçlar yerli tavuk ırklarımızın ChTLR3, ChTLR4, ChTLR5 ve ChTLR15 reseptörleri ile ilişkili hastalıklar bakımından direnç potansiyellerini ortaya koyacaktır.