Türkiye’de Kabak Ve Kavundan İzole Edilen Kabak Sarı Mozaik Virüsünün Karakterizasyonu İçin Kılıf Protein Genlerinin Klonlanması Ve Nükleotid Dizilerinin Tespit Edilmesi Türkiye


CAGLAR B. K., GULDUR M. E., FİDAN H., KAMBEROĞLU M. A., BALOĞLU S., ELBEAİNO T., ...Daha Fazla

Iv. Bitki Koruma Kongresi, Kahramanmaraş, Türkiye, 28 - 30 Haziran 2011, ss.1

  • Yayın Türü: Bildiri / Özet Bildiri
  • Basıldığı Şehir: Kahramanmaraş
  • Basıldığı Ülke: Türkiye
  • Sayfa Sayıları: ss.1
  • Akdeniz Üniversitesi Adresli: Evet

Özet

Kabaktan ve kavundan izole edilen iki siddetli Kabak sarı mozaik virüs (Zucchini yellow mosaic

virus, ZYMV) izolatlarının (sırasıyla ZYMV-Adana (Ad) ve ZYMV-Ahlat (Ah)) genomik

RNAları üzerinde yer alan kılıf protein (CP) genlerinin tamamı klonlanmıs ve nükleotid dizileri ile

amino asit dizileri belirlenmistir. Her iki ZYMV izolatına ait kılıf protein genlerinin 837

nükleotidden olustugu ve yaklasık 31.2kDa büyüklügündeki kılıf proteinini kodladıgı tespit

edilmistir. Filogenetik agaç nükleik asit dizileri temel alınarak neighbor joining yöntemi ile yüz

tekerrürlü olarak olusturulmustur. ZYMV Türk izolatlarının nükleotide dizileri arasında yüksek

düzeyde homoloji tespit edilmistir (% 97). ZYMV-Ad ve ZYMV-Ah izolatlarının kılıf protein

geni, nükleotid düzeyinde karsılastırıldıgı 23 dünya izolatı ile sırasıyla % 93-98 ve % 94-99

oranında benzerlik göstermistir. Farklı cografik bölgelere ait 23 ZYMV izolatı ile nükleotid

düzeyinde yapılan filogenetik analiz sonucunda ZYMVAd izolatı Orta Dogu (Suriye ve Ürdün)

izolatları ile ZYMV-Ah izolatı ise Uzak Dogu (Kore, Tayvan) izolatları ile gruplanmıstır. ZYMVAh

izolatı kılıf proteini N-ucunun oldukça farklı birsekans yapısına sahip oldugu tespit edilmis

(özellikle 699. nükleotide ile 721. nükleotidler arası) buda ZYMV-Ah izolatının karsılastırıldıgı

diger tüm izolatlardan farklı oldugunu ortaya koymustur. Her iki izolatın kılıf proteinlerinin 279

amino asit rezüdüsünden olustugu tespit edilmistir. _zolatların Potyvirüs cinsine dahil 22 farklı

üyesi ile nükleotid düzeyinde yapılan karsılastırmalı analizinde % 58-70 düzeyinde benzerlik

gösterdigi tespit edilmistir. Kabak fidelerine yapılan mekanik inokulasyon çalısmalarında ZYMVAh

izolatının ZYMV-Ad izolatından daha hızlı simptom olusumuna neden oldugu buda ZYMVAh

izolatının ZYMV-Ad izolatından daha siddetli bir izolat oldugunu ortaya koymustur. (Gen

Bankası ulasım no. JF317296-JF317297 )