Akademik Veri Yönetim Sistemi
Yazısız H. (Yürütücü), Eyigör M., Ünal M., Ayaz Y., Koyuncu Özyurt Ö., Özhak B., et al.
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Araştırma Projesi, 2020 - 2023
Mikrobiyal keratit (MK) bakteri, mantar ve/veya protozoanın neden olduğu kornea enfeksiyonunun viral olmayan nedenlerini belirtir. Bakteriyel patojenler arasında keratitten sorumlu olan en yaygın ajanlar arasında Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pneumonia ve Serratia türleri bulunur. Mantar etkenleri arasında Fusarium, Aspergillus, Phaeohyphomycetes, Curvularia, Paecilomyces, Scedosporium ve Candida türleri yer alır. Paraziter etken olarak ise Acanthamoeba spp. sorumludur. MK, görme kaybına neden olabilecek oküler bir acil durumdur. Kültür yöntemleri altın standart yöntem olmasına rağmen bunlar zaman alıcı yöntemlerdir. Bu nedenle de hızlı tanı, tedavi ve antimikrobiyal direnç oranlarını düşürmek için duyarlılığı ve doğruluğu yüksek olan moleküler tanı yöntemlerine ihtiyaç vardır.
Bu çalışmada Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Göz hastalıkları Kliniği’nde mikrobiyal keratit düşünülen ve mikrobiyolojik tanıya ihtiyaç duyulan hastalarda moleküler yöntemler ile bakteriyel/fungal/paraziter etkenlerin saptanmasını amaçlanmıştır. Ayrıca çalışma sırasında Acantamoeba spp. tanısında mikroskobi, kültür, moleküler yöntemlerinin tanı değerleri karşılaştırılacaktır.
Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Göz hastalıkları Kliniği’nde mikrobiyal keratit düşünülen ve tanı için mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen 50-100 arasında hasta örnekleri çalışmaya dahil edilecektir.
Alınan korneal smear sitoloji örnekleri mikroskobik değerlendirme (direkt, Giemsa ve Calcofluor White), kültür (Acantomoeba kültürü için Page-saline besiyeri), moleküler yöntemler (bakteri için 16S, mantarlar için 18S rDNA primerler, Acanthamoeba 18SrDNA) ile çalışma yapılacaktır. Moleküler yöntemler ile pozitif çıkan örneklerin tür tayinleri yapılması için sekans analizi ile dizi tayini yapılacaktır.
Kornea nakline kadar giden patolojilere sebep olan MK etkenleri rutin testler içinde yer almayan yöntemler kullanılarak saptanacak hastaların ampirik olarak başlanmış olan tedavisi düzenlenerek uygun tedavi seçiminde yardımcı olunacaktır. Acantamoeba spp. tanısında ticari olarak standardize edilmiş bir moleküler yöntem ile inhouse olarak kendimizin planladığı ve daha uygun fiyata mal edilecek olan moleküler yöntem karşılaştırılacaktır. İnhouse yöntemin sonuçları uygun görüldüğü takdirde bu yöntem çalışma sonrasında rutin hastaların değerlendirmesinde kullanılacaktır. Aynı zamanda şu anda rutin testler içinde yer almayan Acantamoeba spp. tanısında boyalı mikroskobi, kültür yöntemlerinin çalışma bitiminde rutin çalışmaya açılması amaçlanmaktadır.